地表水

    2005年，全区地表水资源量910.6亿立方米。

河流

    全区监测的47条河流117个断面中，Ⅰ～Ⅲ类水质断面占80.3%，Ⅳ～Ⅴ类占13.7%，劣Ⅴ类占6.0%。主要超标项目是化学需氧量、氨氮等。与上年相比，全区河流的总体水质状况有所好转，Ⅰ～Ⅲ类水质断面的比例上升1.5个百分点。

湖泊、水库

    在监测的7座湖泊中，高山湖泊水质较好，天池、喀纳斯湖水质以Ⅱ～Ⅲ类为主。平原湖泊受到不同程度污染，博斯腾湖、赛里木湖以Ⅳ类水质为主，属轻度污染；柴窝堡湖、艾比湖、乌伦古湖三座尾闾湖均以劣Ⅴ类水质为主，属重度污染。

    在监测的15座水库中，以Ⅱ～Ⅲ类水质为主的水库有5座，占33.3%，其余10座水库水质均存在不同程度的污染。水质较好的是克孜尔水库、白杨河水库、乌鲁瓦提水库，水质较差的是蘑菇湖水库、猛进水库、红雁池水库。

    与上年相比，全区湖库的总体水质状况无明显变化，仍为中度污染水平。